Historique
Le club omnisports de la Jeanne d'Arc de Carquefou est fondé en 1922 sous le patronage de la Fédération de Gymnastique et Sportive de France. Le club devient une structure officielle en 1928 et la section de football voit le jour en septembre 1939. L'Union Sportive de Carquefou et la Jeanne d'Arc de Carquefou fusionnent et donnent naissance à de l'Union Sportive de la Jeanne d'Arc de Carquefou Football le 8 juillet 1942.
Après une longue période d'anonymat passée dans les championnats départementaux et régionaux, Carquefou est promu en DH Atlantique en 1993. L'USJA ne s'y éternise pas. Champion de DH Atlantique dès 1994, Carquefou quitte le niveau régional pour évoluer en compétitions nationales. Troisième du groupe D du CFA2 en 1998, l'USJA est promu à l'étage supérieur où elle se maintient deux saisons. Nouvelle promotion en CFA en 2004, mais retour à l'étage inférieur après une seule saison.
En Coupe de France, Carquefou dispute quatre fois les trente-deuxièmes de finale (1994, 1997, 1998, et 2003) avant de franchir ce palier en 2008 en atteignant les quarts de finale de cette compétition.
Lors de la 28ème journée du Championnat de France Amateur 2 2008-2009, rencontre décisive à domicile contre l'ES Bonchamp (victoire 5 à 1). L'USJA Carquefou Football rejoint alors le Championnat de France Amateur (CFA) pour la saison 2009-2010. En parallèle l'équipe réserve rejoint la Division d'Honneur pour la première fois dans l'histoire du club.
Coupe de France 2008
Le 3 février 2008, l'USJA (alors en CFA2) se qualifie pour les huitièmes de finale de la Coupe de France en s'imposant face à l'AS Nancy Lorraine (Ligue 1) 2-1 après prolongation. Au tour précédent, le club avait battu le FC Gueugnon (Ligue 2) sur le score de 1-0. En huitièmes de finale le 19 mars 2008, dans le stade de la Beaujoire garni de 36 883 spectateurs, Carquefou élimine l'Olympique de Marseille (Ligue 1) sur le score de 1-0 avec un unique but à la 7e minute de Papa N'Doye.
Le 16 avril 2008, le PSG élimine l'USJA, sur le score de 1-0 (but de Pedro Miguel Pauleta).
Parcours détaillé du club, qui fait son entrée dans la compétition
lors du Troisième tour :
| Troisième tour | 22 septembre 2007 ASPTT Nantes football DRS (7e division) 1 - 4 |
| Quatrième tour | 7 octobre 2007 St Jean-de-Boiseau PH (9e division) 0 - 1 |
| Cinquième tour | 21 octobre 2007 La Chapelle-des-Marais DH (6e division) 0 - 2 |
| Sixième tour | 3 novembre 2007 Vendée Luçon Football CFA 2 (5e division) 2 - 0 |
| Septième tour | 24 novembre 2007 Ploërmel FC DSE (7e division) 3 - 1 |
| Huitième tour | 15 décembre 2007 Les Genêts d'Anglet CFA (4e division) 3 - 2 a.p. |
| Trente-deuxièmes de finale | 5 janvier 2008 FC Gueugnon Ligue 2 1 - 0 |
| Seizièmes de finale | 3 février 2008 AS Nancy-Lorraine Ligue 1 2 - 1 a.p. |
| Huitièmes de finale | 19 mars 2008 Olympique de Marseille Ligue 1 1 - 0 |
| Quarts de finale | 16 avril 2008 Paris SG Ligue 1 0 - 1 |
